第1章 概述 1 1.1 什么是R和R Commander 1 1.2 简要回顾R和R Commander 3 1.3 章节概要 5 1.4 进一步说明 6 1.5 本书资源网站 7 第2章 R和R Commander的安装 9 2.1 获取并安装R和R Commander 9 2.2 在Microsoft Windows上安装R和R Commander 10 2.3 在Mac OS X上安装R和R Commander 14 2.3.1 为Mac OS X安装X11(XQuartz)窗口系统 15 2.3.2 安装Rcmdr程序包及其附属程序包 16 2.3.3 防止Mac睡眠模式影响R 16 2.3.4 故障排除 17 2.4 在运行Linux和UNIX的计算机上安装R和R Commander 17 2.5 安装可选的辅助软件:Pandoc和LaTeX 18 第3章 快速浏览R Commander 21 3.1 启动R Commander 21 3.2 R Commander的界面 22 3.3 将数据读入R Commander中 25 3.4 检查和重新编码变量 29 3.5 制作列联表 37 3.6 创建报告 39 3.6.1 通过剪切和粘贴创建报告 40 3.6.2 将报告创建为动态文档 41 3.7 编辑命令* 48 3.8 终止R Commander会话 51 3.9 自定义R Commander* 52 3.9.1 使用“Commander选项”对话框 52 3.9.2 设置Rcmdr程序包选项 54 3.9.3 在R Commander中管理颜色 55 3.9.4 保存R Commander选项 56 第4章 数据输入与数据管理 59 4.1 数据管理概述 59 4.2 数据输入 60 4.2.1 在R Commander数据编辑器中输入数据 60 4.2.2 从纯文本文件中读取数据 63 4.2.3 从电子表格和其他来源导入数据 65 4.2.4 访问R程序包中的数据集 70 4.3 从R Commander保存和导出数据 72 4.4 修改变量 73 4.4.1 重新编码变量 73 4.4.2 计算新变量 75 4.4.3 变量的其他操作 78 4.5 操作数据集 81 4.5.1 对数据集的特殊操作* 82 4.5.2 选取部分案例 83 4.5.3 合并数据集* 85 第5章 数据汇总和图形化 89 5.1 简单的数值总结 89 5.2 列联表 93 5.3 绘制变量分布图 95 5.3.1 图形化数值数据 95 5.3.2 图形化分类数据 99 5.4 绘制关系图 102 5.4.1 简单的散点图 102 5.4.2 增强型散点图* 104 5.4.3 散点图矩阵 105 5.4.4 散点图和散点图矩阵中的点识别 107 5.4.5 3D散点图* 108 5.4.6 绘制平均数 110 第6章 简单的统计检验 113 6.1 平均数检验 113 6.1.1 独立样本的平均数差异T检验 113 6.1.2 单因素(因子)方差分析 116 6.1.3 双因素(因子)和多因素(因子)方差分析 121 6.2 比例检验 123 6.3 方差检验 126 6.4 非参数检验 127 6.5 其他简单检验* 128 第7章 拟合线性模型和广义线性模型 131 7.1 线性回归模型 131 7.2 带有因子的线性模型* 134 7.2.1 线性模型公式 135 7.2.2 边际原则 136 7.2.3 使用加拿大职业声望数据的例子 137 7.2.4 虚拟变量和因子变量的其他对比方式 141 7.3 拟合回归样条和多项式* 144 7.3.1 多项式项 144 7.3.2 回归样条 146 7.4 广义线性模型* 147 7.5 其他回归模型* 151 7.6 可视化线性模型和广义线性模型* 151 7.7 系数的置信区间和假设检验 156 7.7.1 置信区间 157 7.7.2 方差分析和偏差表分析* 157 7.7.3 检验比较模型* 159 7.7.4 检验线性假设* 161 7.8 回归模型诊断* 162 7.9 模型选择* 166 第8章 概率分布与模拟 169 8.1 运用概率分布 169 8.1.1 连续型分布 169 8.1.2 离散型分布 172 8.2 绘制概率分布 173 8.3 简单随机模拟 175 8.3.1 设置R伪随机数发生器的种子 176 8.3.2 **极限定理的简单模拟示例 177 第9章 使用R Commander插件包 181 9.1 获取和加载插件 181 9.2 使用RcmdrPlugin.TeachingDemos包 183 9.3 使用RcmdrPlugin.survival包进行幸存分析* 185 附录A R Commander菜单指南 195