本教材是一本全面介绍蛋白质组信息学领域的教材，旨在向读者介绍蛋白质组信息学的基本概念和技术，同时紧密跟踪国际、国内在蛋白质组信息学领域的发展，让读者了解该领域的前沿信息，并掌握相关知识。本教材分为四篇，共十七章。**篇介绍了蛋白质组信息学的基础知识，包括蛋白质组和信息学的基本概念及二者之间的关系、蛋白质组学中的实验方法和应用、蛋白质芯片技术及相关数据分析。第二篇侧重于蛋白质组的功能，包括蛋白质亚细胞定位、分泌蛋白质和膜蛋白、糖蛋白和糖修饰、蛋白质修饰等方面的信息学。第三篇关注蛋白质相互作用和演化，包括蛋白质相互作用的计算与分析、结构蛋白质组学和新基因起源与蛋白质组演化信息学。第四篇为蛋白质组学的应用，包括噬菌体展示技术及其在蛋白质组学中的应用、基于蛋白质组学的**设计、固有无序蛋白质组信息学、蛋白质组大数据和深度学习以及蛋白质受体配体结构、功能与信息学。