《微生物学实验》第5 版仍遵循第3 版和第4 版的编写指导思想和基本要求，并按照第4 版做法分成“微生物学基本实验技术”和“微生物学综合型、研究型实验”两大部分，但对其内容和形式均进行了更新和修订。*部分包括：无菌概念和无菌操作，消毒**，分离纯化，显微观察，涂片染色，培养基及微生物培养，生理生化反应，快速微量检测，基因突变，基因转移，基因文库构建，PCR 技术及其在鉴定细菌中的应用，免疫学的基本技术等。第二部分包括：高产蛋白酶（或其他代谢产物）菌株的筛选及其基因的克隆和表达，杀虫微生物的分离，微生物产沼气，水和食品的微生物检测，酸乳、啤酒和泡菜的制作，人体表面正常菌群的分离鉴定，用互联网和计算机辅助基因分析鉴定古菌和细菌，细菌系统发育树的构建，发现和鉴定细菌新种，用来分离严格厌氧菌的“滚管实验”等。其内容涉及微生物在工业、农业、环境、食品、医学等领域的应用。