在宇宙世纪（U.C.）0093年，那个妄图将阿克西斯推向地球、引发“核冬天”的男人——夏亚·阿兹纳布尔，在高达的反抗之下*终失败身死，十二年后，即U.C.0105年，地球与宇宙殖民地仍是一片混乱，愈加腐败的地球联邦却一心考虑如何把留在地球的平民送上宇宙，只留下特权**享受地球的美景。 在这种局面下，出现了一位化名为马夫蒂·纳比尤·艾林的人物，他与同名组织“马夫蒂”，以地球联邦的高官阁僚为目标，不断实施暗杀行动。而这位马夫蒂的真面目，竟然是在当年夏亚叛乱之时，还是少年就驾驶机动战士出战的哈萨维·诺亚，而他的父亲则是鼎鼎大名的地球联邦舰长布莱德·诺亚。 父亲是地球联邦的英雄，自己却是反地球联邦的头领，究竟是怎样的经历让哈萨维走上了这样一条不归之路？当哈萨维隐藏身份，与地球联邦的阁僚们同乘航天飞机降落至地球时，他又看到了什么？是不可一世的阁僚们，还是在飞机里惊艳了所有人的美丽少女——琪琪？

琪琪·安达露西娅洗完澡后只觉得燥热，便径直去别墅的阳台纳凉，让全身感受傍晚的空气，海上吹来的风似乎为她的细胞注入了活力。
“呼……”
琪琪用双手向后扬了扬头发，让脖颈也被风吹拂。她不喜欢用毛巾卷头发，觉得那样很压抑。
她用上半身倚着栏杆，环视暮色迟至的海面。视野两侧的平缓山脊融入海岸线，左侧的山脊已染上了黑色，平静的海面也从深蓝色渐渐变成黑色，做好了入夜的准备。
“哈萨维·诺亚……”
那个看似神经质却有爆发力的青年就在这片大海的另一边，一想到这里，琪琪就情不自禁地激动起来。然而，她所在的这栋别墅距离基地没多远，与哈萨维敌对的男人—喀耳刻部队的肯尼斯·斯莱格，就在基地里。
对于只得卖身给老人的琪琪来说，看那两个男人交锋会非常愉快。可话虽如此，她自己并不能做些什么，一想到他们的未来，她就感到不安。所以，她为了不去想这个和自己也有关系的问题，才尽情地洗了个澡，走上阳台纳凉。
但是，身处哈萨维和肯尼斯这两个男人之间的立场，依然刺激到了琪琪。

（上） 序 1 琪琪 2 休息室 3 肯尼斯 4 劫机 5 哈萨维 6 着陆地 7 和琪琪一起 8 酒店 9 联络 10 猎人 11 米诺夫斯基飞行器 12 惊吓 13 指挥官 14 年轻的驾驶员 15 喀耳刻部队 16 逃亡之路 17 海洋上 18 餐厅 19 “海椰子” 20 追捕之路 21 起飞 22 对决 （中） 1 处境 2 凯莉亚·德斯 3 英勇号 4 途经运河 5 欧恩贝��的印记 6 马夫蒂·纳比尤·艾林 7 琪琪和肯尼斯 8 公寓 9 床上内衣 10 探求 11 女孩和女人 12 离开达尔文市 13 信息 14 暗夜之伤 15 琪琪之泉 16 两个隆迪尼翁 17 乌鲁鲁 18 狭窄的空间 （下） 1 本地广播 2 障眼法 3 不同的处境 4 早晨时 5 连续起飞 6 精准防卫 7 取得成功 8 森林之下 9 再度 10 战败 11 尘卷风 12 行刑前日 13 枪决 14 在那之后 15 马兰比吉