本次整理点校，以安徽人民出版社1959年线装排印本为底本，以中国中医药出版社1997年排印本《中国医学大成》第8册内的《程杏轩医案》为对校本（简称医学大成本）。在整理过程中，采取的具体方法和原则是：
1.统一目录。底本存在着的少数正文标题与书前目录不一致的地方，现统一目录，使正文标题与书前目录一致。
2.繁体字改为规范的简化字。但人名、地名中的繁体字如会产生误解，则仍保留原貌，不加改动。
3.底本中属笔画小误的错字，径改。如“日”误作“日”，“已”误作“己”，“大”误作“太”之类，均予径改。
4。底本与校本文字不同，若底本较优，则依底本；若系底本错讹者，则据校本改正后出校；如属校本有误而底本不误者，则不出校；若难以肯定何者为是，或两者文字均有可取需并存者，则不改，出校。
5.对某些疑难词语和专业术语酌加注释。

医案初集
新安杏轩程文囿观泉甫著
弟文畹绮兰、文荃春圃校，
侄光庭鉴亭、光庠养和录
许静亭翁夫人产后感邪，重用清下治验
丹溪云：产后当以大补气血为主，他证从末治之。言固善矣，然事竞有不可执者。乾隆乙巳仲夏，岩镇许静亭翁夫人病，延诊。据述产后十二朝，初起洒淅寒热，医投温散不解，即进温补，病渐加重，热发不退口渴心烦，胸闷便闭。时值溽暑，病人楼居，闭户塞牖。诊脉弦数，视舌苔黄。告静翁曰：“夫人病候，乃产后感邪，医药姑息，邪无出路，郁而为热。**本欲即用重剂清解，恐生疑畏，且与一柴胡饮试之，但病重药轻，不能见效，明早再为进步。”蓝令移榻下楼，免暑气蒸逼。诘朝视之，脉证如故，舌胎转黑，众犹疑是阴证。予曰：“不然。阴阳二证，舌胎皆黑。阴证舌黑，黑而润滑，病初即见，肾水凌心也；阳证舌黑，黑而焦干，热久才见，薪化为炭也。”前方力薄，不能胜任，议用白虎汤加芩连。饮药周时，家人报曰：“热退手足微冷。”少顷，又曰：“周身冷甚。”静翁骇然，亦谓恐系阴证，服此药必殆。予曰：“无忧。果系阴证，前服温补药效矣，否则昨服柴胡饮死矣，安能延至此刻？此即仲景所谓热深厥亦深也。姑待之。”薄暮厥回，复热烦渴，欲饮冷水。令取井水一碗与饮，甚快。予曰：“扬汤止沸，不若釜底抽薪。”竟与玉烛散下之。初服不动，再剂便解黑矢五六枚，热势稍轻，改用玉女煎数剂，诸候悉平，调养经月而愈。众尚虑其产后凉药服多，不能生育。予曰：“无伤。经日有故无殒。”至今廿载，数生子女矣。壬戌岁，与订朱陈焉。予来岩镇谭医，自静翁始。
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初刻原序一
初刻原序二
初刻原序三
初刻自序
初刻医案二集序
初刻医案二集序二
初刻医案二集序三
医案三集序
二刻本跋
医案初集
许静亭翁夫人产后感邪，重用清下治验
刘明府少君先天不足，心脾内亏治法
鲍觉生宫詹郁伤心脾，证类噎隔，殆而复生
洪楚峰孝廉中脏殆证，再生奇验
方萃岩翁公郎滑精证治
余氏子疟后变讧
汪典扬翁外孙女体弱感邪，证变抽掣
方玉堂翁孙女暑风惊证，详论病机治法
方宅揆翁幼孙暑风惊证，病愈之奇
洪荔原翁尊堂大头时疫，真热假寒之证
又夫人子嗽
族兄奏韩挟虚伤寒，因循贻误，救治原委
方牧夫兄尊堂寒湿内伏，加感外邪
曹近轩翁感后食复
曹、肖岩翁春温两感危证
又三郎麻闭急证
吴芳崖兄幼孙胎疟
方理丰翁中寒脱阳，殆证救苏
方晋偕翁乃媳咳嗽成痨，预决不治
潘氏室女经闭成痨，不治之证
方灿侣翁腹痛蓄瘀脱血治愈，并商善后法
农人某攻痞动血，昏晕急证
王以仁翁乃郎暑病热久伤阴
又翁自病肝郁，证似外感
吴秀森翁干脚气
洪临川兄幼女偏废
吴礼庭兄时感肿腮消后，睾丸肿痛
庄炳南兄素禀火体，病治与众不同
柳荫千兄令爱无故发癍
柳闻莺兄挟虚伤寒，并后患阴疟，误截致变，拯治始末
方绣文兄夫人怀孕，日吐清涎数碗
曹德酹兄乃郎水肿
方侬葭兄伤寒转疟，并论胎疟病因
闵方田兄初患少阴伤寒喉痹，治愈后，患脚气，杂治成痿
汪心涤兄夫人半产血晕危证
吴立亭翁幼孙伤暑危证治验
梅文彩兄令堂病类噎隔奇证
郑鹤呜夹阴伤寒
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医案续录
医案辑录