本书讲述了生物信息概述、数据采集、数据库——内容、结构和注释、生物数据检索、通过序列相似性标准搜索序列数据库、多阵列数据分析等内容。

序
原版前言
缩略语
A 生物信息学概述
A1生物信息学的范围
A2生物信息学与互联网
A3有用的生物信息学WWW网站
B 数据采集
B1DNA、RNA和蛋白质测序
B2蛋白质结构的确定
B3基因和蛋白质表达数据
B4蛋白质互作数据
C 数据库——内容、结构和注释
C1文件格式
C2已注释的序列数据库
C3基因组和特定物种的数据库
C4其他数据库
D 生物数据检索
D1通过Entrez和 DBGET/LINKDB的数据检索
D2使用SRS(序列检索系统)的数据检索
E 通过序列相似性标准搜索序列数据库
E1序列相似性搜索
E2氨基酸替代矩阵
E3数据库搜索:FASTA和 BLAST
E4序列过滤程序
E5数据库的迭代搜索和PSI-BLAST
F 多序列联配:基因和蛋白质家族
F1多序列联配和家族关系
F2蛋白质家族和模式数据库
F3蛋白质结构域家族
G 系统发育学
G1系统发育学、遗传分类学和存在论
G2构建系统发育树
G3大分子序列进化
H 序列注释
H1基因组注释原理
H2注释工具和资源
I 结构信息学
I1蛋白质结构的概念模型
I2蛋白质三维结构与蛋白质功能的关系
I3蛋白质结构和功能的进化
I4获取、观察和分析结构数据
I5结构联配
I6 已知三维结构的蛋白质分类:CATH与SCOP
I7蛋白质结构预测简介
I8通过比较建模预测结构
I9二级结构预测
I10**蛋白质结构预测与预测策略
J 微阵列数据分析
J1微阵列数据:分析方法
J2微阵列数据:工具和资源
J3序列采样和SAGE
K 蛋白质组数据分析
K1双向凝胶电泳数据分析
K2蛋白质质谱数据分析
L 高阶模型
L1分子途径的建模与重建
L2蛋白质互作生物信息学
L3高阶模型
M 生物学中的化学信息学
M1分子表示的规范
M2化学信息学资源
N 制药业中的生物信息学
N1生物信息学和**发现
N2**信息学资源
O 生物信息学计算的基本原理
O1运行计算机软件
O2计算机操作系统
O3软件下载和安装
O4数据库管理
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术语表